Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Polr1aO35134 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Polr1aO35134 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Polr1aO35134 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Polr1aO35134 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Polr1aO35134 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Polr1aO35134 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Polr1aO35134 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Polr1aO35134 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Polr1aO35134 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Polr1aO35134 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Polr1aO35134 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Polr1aO35134 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Polr1aO35134 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Polr1aO35134 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Polr1aO35134 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Polr1aO35134 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Polr1aO35134 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Polr1aO35134 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Polr1aO35134 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Polr1aO35134 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Polr1aO35134 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Polr1aO35134 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Polr1aO35134 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Polr1aO35134 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Polr1aO35134 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Polr1aO35134 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Polr1aO35134 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Polr1aO35134 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Polr1aO35134 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Polr1aO35134 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Polr1aO35134 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Polr1aO35134 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Polr1aO35134 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Polr1aO35134 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Polr1aO35134 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Polr1aO35134 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Polr1aO35134 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Polr1aO35134 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Polr1aO35134 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Polr1aO35134 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Polr1aO35134 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Polr1aO35134 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Polr1aO35134 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Polr1aO35134 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Polr1aO35134 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Polr1aO35134 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Polr1aO35134 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Polr1aO35134 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Polr1aO35134 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Polr1aO35134 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Polr1aO35134 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Polr1aO35134 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Polr1aO35134 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Polr1aO35134 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Polr1aO35134 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Polr1aO35134 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Polr1aO35134 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Polr1aO35134 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Polr1aO35134 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Polr1aO35134 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Polr1aO35134 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Polr1aO35134 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Polr1aO35134 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Polr1aO35134 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Polr1aO35134 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Polr1aO35134 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Polr1aO35134 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Polr1aO35134 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Polr1aO35134 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Polr1aO35134 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Polr1aO35134 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Polr1aO35134 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Polr1aO35134 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Polr1aO35134 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Polr1aO35134 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Polr1aO35134 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Polr1aO35134 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Polr1aO35134 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Polr1aO35134 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Polr1aO35134 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Polr1aO35134 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Polr1aO35134 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Polr1aO35134 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Polr1aO35134 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Polr1aO35134 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Polr1aO35134 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Polr1aO35134 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Polr1aO35134 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Polr1aO35134 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Polr1aO35134 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Polr1aO35134 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Polr1aO35134 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Polr1aO35134 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Polr1aO35134 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Polr1aO35134 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Polr1aO35134 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Polr1aO35134 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Polr1aO35134 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Polr1aO35134 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms