Protein–RNA interactions for Protein: O09005

Degs1, Sphingolipid delta(4)-desaturase DES1, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Degs1O09005 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
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Degs1O09005 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Degs1O09005 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Degs1O09005 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Degs1O09005 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Degs1O09005 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Degs1O09005 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Degs1O09005 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Degs1O09005 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Degs1O09005 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Degs1O09005 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Degs1O09005 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Degs1O09005 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Degs1O09005 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Degs1O09005 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Degs1O09005 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Degs1O09005 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Degs1O09005 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Degs1O09005 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Degs1O09005 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Degs1O09005 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Degs1O09005 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Degs1O09005 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Degs1O09005 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Degs1O09005 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Degs1O09005 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Degs1O09005 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Degs1O09005 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Degs1O09005 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Degs1O09005 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Degs1O09005 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Degs1O09005 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.8 ms