Protein–RNA interactions for Protein: O08688

Capn5, Calpain-5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn5O08688 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn5O08688 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn5O08688 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn5O08688 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capn5O08688 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capn5O08688 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capn5O08688 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Capn5O08688 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capn5O08688 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capn5O08688 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capn5O08688 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capn5O08688 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capn5O08688 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capn5O08688 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capn5O08688 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capn5O08688 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capn5O08688 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capn5O08688 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capn5O08688 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capn5O08688 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capn5O08688 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capn5O08688 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn5O08688 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn5O08688 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn5O08688 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn5O08688 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn5O08688 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn5O08688 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn5O08688 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn5O08688 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn5O08688 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn5O08688 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn5O08688 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn5O08688 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn5O08688 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn5O08688 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn5O08688 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn5O08688 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn5O08688 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms