Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm2056J3QQ02 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm2056J3QQ02 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm2056J3QQ02 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm2056J3QQ02 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm2056J3QQ02 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm2056J3QQ02 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm2056J3QQ02 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm2056J3QQ02 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm2056J3QQ02 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm2056J3QQ02 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm2056J3QQ02 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm2056J3QQ02 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm2056J3QQ02 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm2056J3QQ02 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm2056J3QQ02 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm2056J3QQ02 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm2056J3QQ02 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Gm2056J3QQ02 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm2056J3QQ02 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
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Gm2056J3QQ02 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Gm2056J3QQ02 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm2056J3QQ02 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Gm2056J3QQ02 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Gm2056J3QQ02 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm2056J3QQ02 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm2056J3QQ02 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm2056J3QQ02 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm2056J3QQ02 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Gm2056J3QQ02 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Gm2056J3QQ02 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm2056J3QQ02 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm2056J3QQ02 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Gm2056J3QQ02 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm2056J3QQ02 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm2056J3QQ02 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm2056J3QQ02 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm2056J3QQ02 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm2056J3QQ02 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Gm2056J3QQ02 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm2056J3QQ02 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm2056J3QQ02 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm2056J3QQ02 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm2056J3QQ02 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm2056J3QQ02 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm2056J3QQ02 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm2056J3QQ02 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm2056J3QQ02 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm2056J3QQ02 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm2056J3QQ02 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm2056J3QQ02 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm2056J3QQ02 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm2056J3QQ02 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm2056J3QQ02 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm2056J3QQ02 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm2056J3QQ02 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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