Protein–RNA interactions for Protein: J3QPL3

Gm5225, Predicted gene 5225, mousemouse

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Length 108 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5225J3QPL3 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5225J3QPL3 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5225J3QPL3 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5225J3QPL3 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm5225J3QPL3 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm5225J3QPL3 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm5225J3QPL3 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm5225J3QPL3 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm5225J3QPL3 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm5225J3QPL3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm5225J3QPL3 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm5225J3QPL3 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm5225J3QPL3 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm5225J3QPL3 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm5225J3QPL3 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm5225J3QPL3 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm5225J3QPL3 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm5225J3QPL3 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm5225J3QPL3 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm5225J3QPL3 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm5225J3QPL3 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm5225J3QPL3 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm5225J3QPL3 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm5225J3QPL3 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm5225J3QPL3 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm5225J3QPL3 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5225J3QPL3 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5225J3QPL3 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5225J3QPL3 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5225J3QPL3 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5225J3QPL3 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5225J3QPL3 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5225J3QPL3 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5225J3QPL3 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5225J3QPL3 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5225J3QPL3 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5225J3QPL3 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5225J3QPL3 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5225J3QPL3 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5225J3QPL3 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5225J3QPL3 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5225J3QPL3 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5225J3QPL3 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5225J3QPL3 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5225J3QPL3 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5225J3QPL3 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5225J3QPL3 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5225J3QPL3 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5225J3QPL3 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5225J3QPL3 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5225J3QPL3 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5225J3QPL3 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5225J3QPL3 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5225J3QPL3 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5225J3QPL3 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5225J3QPL3 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5225J3QPL3 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5225J3QPL3 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5225J3QPL3 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5225J3QPL3 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5225J3QPL3 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5225J3QPL3 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5225J3QPL3 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5225J3QPL3 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5225J3QPL3 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5225J3QPL3 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5225J3QPL3 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5225J3QPL3 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5225J3QPL3 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm5225J3QPL3 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm5225J3QPL3 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm5225J3QPL3 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm5225J3QPL3 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm5225J3QPL3 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm5225J3QPL3 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm5225J3QPL3 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm5225J3QPL3 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm5225J3QPL3 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm5225J3QPL3 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm5225J3QPL3 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm5225J3QPL3 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm5225J3QPL3 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm5225J3QPL3 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm5225J3QPL3 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm5225J3QPL3 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm5225J3QPL3 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm5225J3QPL3 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm5225J3QPL3 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm5225J3QPL3 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm5225J3QPL3 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm5225J3QPL3 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm5225J3QPL3 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm5225J3QPL3 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5225J3QPL3 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5225J3QPL3 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5225J3QPL3 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5225J3QPL3 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5225J3QPL3 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5225J3QPL3 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5225J3QPL3 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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