Protein–RNA interactions for Protein: J3QNW5

Gm21797, Predicted gene, 21797, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21797J3QNW5 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm21797J3QNW5 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm21797J3QNW5 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm21797J3QNW5 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm21797J3QNW5 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm21797J3QNW5 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm21797J3QNW5 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm21797J3QNW5 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm21797J3QNW5 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm21797J3QNW5 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm21797J3QNW5 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm21797J3QNW5 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm21797J3QNW5 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm21797J3QNW5 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm21797J3QNW5 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm21797J3QNW5 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm21797J3QNW5 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm21797J3QNW5 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm21797J3QNW5 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm21797J3QNW5 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm21797J3QNW5 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm21797J3QNW5 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm21797J3QNW5 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm21797J3QNW5 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm21797J3QNW5 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm21797J3QNW5 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm21797J3QNW5 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm21797J3QNW5 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm21797J3QNW5 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm21797J3QNW5 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm21797J3QNW5 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm21797J3QNW5 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm21797J3QNW5 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm21797J3QNW5 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm21797J3QNW5 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm21797J3QNW5 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm21797J3QNW5 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm21797J3QNW5 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm21797J3QNW5 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm21797J3QNW5 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm21797J3QNW5 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm21797J3QNW5 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm21797J3QNW5 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm21797J3QNW5 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm21797J3QNW5 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm21797J3QNW5 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm21797J3QNW5 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm21797J3QNW5 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm21797J3QNW5 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm21797J3QNW5 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm21797J3QNW5 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm21797J3QNW5 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm21797J3QNW5 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm21797J3QNW5 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm21797J3QNW5 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm21797J3QNW5 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm21797J3QNW5 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm21797J3QNW5 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm21797J3QNW5 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm21797J3QNW5 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm21797J3QNW5 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm21797J3QNW5 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm21797J3QNW5 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm21797J3QNW5 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm21797J3QNW5 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm21797J3QNW5 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm21797J3QNW5 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm21797J3QNW5 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm21797J3QNW5 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm21797J3QNW5 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm21797J3QNW5 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm21797J3QNW5 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm21797J3QNW5 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm21797J3QNW5 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm21797J3QNW5 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm21797J3QNW5 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm21797J3QNW5 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm21797J3QNW5 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm21797J3QNW5 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm21797J3QNW5 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm21797J3QNW5 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm21797J3QNW5 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm21797J3QNW5 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm21797J3QNW5 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm21797J3QNW5 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm21797J3QNW5 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm21797J3QNW5 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm21797J3QNW5 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm21797J3QNW5 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm21797J3QNW5 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm21797J3QNW5 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm21797J3QNW5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm21797J3QNW5 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm21797J3QNW5 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm21797J3QNW5 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm21797J3QNW5 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm21797J3QNW5 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm21797J3QNW5 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm21797J3QNW5 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm21797J3QNW5 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms