Protein–RNA interactions for Protein: J3QK56

4930544D05Rik, RIKEN cDNA 4930544D05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544D05RikJ3QK56 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms