Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
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