Protein–RNA interactions for Protein: G3X9K3

Arfgef1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef1G3X9K3 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Arfgef1G3X9K3 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arfgef1G3X9K3 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arfgef1G3X9K3 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arfgef1G3X9K3 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Arfgef1G3X9K3 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arfgef1G3X9K3 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arfgef1G3X9K3 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arfgef1G3X9K3 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arfgef1G3X9K3 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arfgef1G3X9K3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arfgef1G3X9K3 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arfgef1G3X9K3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Arfgef1G3X9K3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Arfgef1G3X9K3 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Arfgef1G3X9K3 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Arfgef1G3X9K3 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Arfgef1G3X9K3 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Arfgef1G3X9K3 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Arfgef1G3X9K3 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Arfgef1G3X9K3 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Arfgef1G3X9K3 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Arfgef1G3X9K3 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Arfgef1G3X9K3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Arfgef1G3X9K3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Arfgef1G3X9K3 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Arfgef1G3X9K3 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Arfgef1G3X9K3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Arfgef1G3X9K3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Arfgef1G3X9K3 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Arfgef1G3X9K3 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Arfgef1G3X9K3 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Arfgef1G3X9K3 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Arfgef1G3X9K3 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Arfgef1G3X9K3 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Arfgef1G3X9K3 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Arfgef1G3X9K3 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Arfgef1G3X9K3 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arfgef1G3X9K3 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arfgef1G3X9K3 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arfgef1G3X9K3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arfgef1G3X9K3 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arfgef1G3X9K3 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Arfgef1G3X9K3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arfgef1G3X9K3 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arfgef1G3X9K3 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Arfgef1G3X9K3 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arfgef1G3X9K3 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arfgef1G3X9K3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arfgef1G3X9K3 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arfgef1G3X9K3 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arfgef1G3X9K3 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arfgef1G3X9K3 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arfgef1G3X9K3 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arfgef1G3X9K3 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arfgef1G3X9K3 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arfgef1G3X9K3 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arfgef1G3X9K3 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arfgef1G3X9K3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arfgef1G3X9K3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arfgef1G3X9K3 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arfgef1G3X9K3 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arfgef1G3X9K3 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arfgef1G3X9K3 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arfgef1G3X9K3 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arfgef1G3X9K3 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arfgef1G3X9K3 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Arfgef1G3X9K3 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arfgef1G3X9K3 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arfgef1G3X9K3 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arfgef1G3X9K3 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arfgef1G3X9K3 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arfgef1G3X9K3 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arfgef1G3X9K3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arfgef1G3X9K3 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arfgef1G3X9K3 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arfgef1G3X9K3 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arfgef1G3X9K3 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arfgef1G3X9K3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arfgef1G3X9K3 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arfgef1G3X9K3 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Arfgef1G3X9K3 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Arfgef1G3X9K3 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arfgef1G3X9K3 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arfgef1G3X9K3 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arfgef1G3X9K3 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arfgef1G3X9K3 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arfgef1G3X9K3 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arfgef1G3X9K3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arfgef1G3X9K3 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arfgef1G3X9K3 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arfgef1G3X9K3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arfgef1G3X9K3 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arfgef1G3X9K3 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arfgef1G3X9K3 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arfgef1G3X9K3 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Arfgef1G3X9K3 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arfgef1G3X9K3 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arfgef1G3X9K3 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arfgef1G3X9K3 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms