Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Crocc2F6XLV1 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Crocc2F6XLV1 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Crocc2F6XLV1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Crocc2F6XLV1 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Crocc2F6XLV1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Crocc2F6XLV1 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Crocc2F6XLV1 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Crocc2F6XLV1 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Crocc2F6XLV1 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Crocc2F6XLV1 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Crocc2F6XLV1 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Crocc2F6XLV1 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Crocc2F6XLV1 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Crocc2F6XLV1 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Crocc2F6XLV1 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Crocc2F6XLV1 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Crocc2F6XLV1 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Crocc2F6XLV1 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Crocc2F6XLV1 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Crocc2F6XLV1 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Crocc2F6XLV1 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Crocc2F6XLV1 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Crocc2F6XLV1 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Crocc2F6XLV1 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Crocc2F6XLV1 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Crocc2F6XLV1 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Crocc2F6XLV1 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Crocc2F6XLV1 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Crocc2F6XLV1 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Crocc2F6XLV1 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Crocc2F6XLV1 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Crocc2F6XLV1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Crocc2F6XLV1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Crocc2F6XLV1 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Crocc2F6XLV1 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Crocc2F6XLV1 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Crocc2F6XLV1 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Crocc2F6XLV1 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Crocc2F6XLV1 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Crocc2F6XLV1 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Crocc2F6XLV1 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Crocc2F6XLV1 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Crocc2F6XLV1 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Crocc2F6XLV1 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Crocc2F6XLV1 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Crocc2F6XLV1 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Crocc2F6XLV1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Crocc2F6XLV1 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Crocc2F6XLV1 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Crocc2F6XLV1 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Crocc2F6XLV1 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Crocc2F6XLV1 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Crocc2F6XLV1 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Crocc2F6XLV1 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Crocc2F6XLV1 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Crocc2F6XLV1 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Crocc2F6XLV1 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Crocc2F6XLV1 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Crocc2F6XLV1 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Crocc2F6XLV1 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Crocc2F6XLV1 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Crocc2F6XLV1 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Crocc2F6XLV1 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Crocc2F6XLV1 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Crocc2F6XLV1 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Crocc2F6XLV1 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Crocc2F6XLV1 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Crocc2F6XLV1 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Crocc2F6XLV1 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Crocc2F6XLV1 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Crocc2F6XLV1 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Crocc2F6XLV1 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Crocc2F6XLV1 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Crocc2F6XLV1 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Crocc2F6XLV1 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Crocc2F6XLV1 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Crocc2F6XLV1 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Crocc2F6XLV1 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Crocc2F6XLV1 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Crocc2F6XLV1 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Crocc2F6XLV1 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Crocc2F6XLV1 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Crocc2F6XLV1 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Crocc2F6XLV1 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Crocc2F6XLV1 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Crocc2F6XLV1 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Crocc2F6XLV1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Crocc2F6XLV1 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Crocc2F6XLV1 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Crocc2F6XLV1 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Crocc2F6XLV1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Crocc2F6XLV1 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Crocc2F6XLV1 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Crocc2F6XLV1 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Crocc2F6XLV1 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Crocc2F6XLV1 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Crocc2F6XLV1 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Crocc2F6XLV1 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Crocc2F6XLV1 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms