Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm340F6RGI3 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms