Protein–RNA interactions for Protein: F2Z3U3

Raph1, Ras association (RalGDS/AF-6) and pleckstrin homology domains 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Raph1F2Z3U3 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms