Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms