Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Y3

Ccdc7b, Coiled-coil domain-containing 7B, mousemouse

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Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7bE9Q9Y3 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ccdc7bE9Q9Y3 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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