Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9P8

Rdh16f1, RDH16 family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f1E9Q9P8 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rdh16f1E9Q9P8 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh16f1E9Q9P8 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh16f1E9Q9P8 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh16f1E9Q9P8 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh16f1E9Q9P8 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh16f1E9Q9P8 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh16f1E9Q9P8 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh16f1E9Q9P8 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh16f1E9Q9P8 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh16f1E9Q9P8 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh16f1E9Q9P8 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh16f1E9Q9P8 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh16f1E9Q9P8 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh16f1E9Q9P8 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh16f1E9Q9P8 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh16f1E9Q9P8 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh16f1E9Q9P8 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh16f1E9Q9P8 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh16f1E9Q9P8 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh16f1E9Q9P8 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh16f1E9Q9P8 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh16f1E9Q9P8 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh16f1E9Q9P8 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh16f1E9Q9P8 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh16f1E9Q9P8 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh16f1E9Q9P8 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh16f1E9Q9P8 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh16f1E9Q9P8 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh16f1E9Q9P8 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh16f1E9Q9P8 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh16f1E9Q9P8 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh16f1E9Q9P8 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh16f1E9Q9P8 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh16f1E9Q9P8 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh16f1E9Q9P8 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh16f1E9Q9P8 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh16f1E9Q9P8 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh16f1E9Q9P8 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh16f1E9Q9P8 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh16f1E9Q9P8 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh16f1E9Q9P8 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh16f1E9Q9P8 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh16f1E9Q9P8 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh16f1E9Q9P8 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh16f1E9Q9P8 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh16f1E9Q9P8 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh16f1E9Q9P8 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh16f1E9Q9P8 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rdh16f1E9Q9P8 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rdh16f1E9Q9P8 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rdh16f1E9Q9P8 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rdh16f1E9Q9P8 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rdh16f1E9Q9P8 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rdh16f1E9Q9P8 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Rdh16f1E9Q9P8 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rdh16f1E9Q9P8 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rdh16f1E9Q9P8 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rdh16f1E9Q9P8 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rdh16f1E9Q9P8 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rdh16f1E9Q9P8 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rdh16f1E9Q9P8 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rdh16f1E9Q9P8 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rdh16f1E9Q9P8 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rdh16f1E9Q9P8 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rdh16f1E9Q9P8 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rdh16f1E9Q9P8 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rdh16f1E9Q9P8 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rdh16f1E9Q9P8 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rdh16f1E9Q9P8 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rdh16f1E9Q9P8 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rdh16f1E9Q9P8 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rdh16f1E9Q9P8 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rdh16f1E9Q9P8 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rdh16f1E9Q9P8 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rdh16f1E9Q9P8 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rdh16f1E9Q9P8 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rdh16f1E9Q9P8 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rdh16f1E9Q9P8 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rdh16f1E9Q9P8 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rdh16f1E9Q9P8 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rdh16f1E9Q9P8 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rdh16f1E9Q9P8 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rdh16f1E9Q9P8 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rdh16f1E9Q9P8 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rdh16f1E9Q9P8 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rdh16f1E9Q9P8 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rdh16f1E9Q9P8 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rdh16f1E9Q9P8 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rdh16f1E9Q9P8 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rdh16f1E9Q9P8 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rdh16f1E9Q9P8 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rdh16f1E9Q9P8 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rdh16f1E9Q9P8 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rdh16f1E9Q9P8 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rdh16f1E9Q9P8 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rdh16f1E9Q9P8 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rdh16f1E9Q9P8 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rdh16f1E9Q9P8 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rdh16f1E9Q9P8 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms