Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9K5

Trdn, Triadin, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrdnE9Q9K5 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TrdnE9Q9K5 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TrdnE9Q9K5 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TrdnE9Q9K5 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TrdnE9Q9K5 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TrdnE9Q9K5 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TrdnE9Q9K5 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TrdnE9Q9K5 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TrdnE9Q9K5 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TrdnE9Q9K5 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TrdnE9Q9K5 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TrdnE9Q9K5 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TrdnE9Q9K5 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TrdnE9Q9K5 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TrdnE9Q9K5 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TrdnE9Q9K5 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TrdnE9Q9K5 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TrdnE9Q9K5 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TrdnE9Q9K5 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TrdnE9Q9K5 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TrdnE9Q9K5 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TrdnE9Q9K5 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TrdnE9Q9K5 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TrdnE9Q9K5 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TrdnE9Q9K5 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TrdnE9Q9K5 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TrdnE9Q9K5 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TrdnE9Q9K5 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TrdnE9Q9K5 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TrdnE9Q9K5 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TrdnE9Q9K5 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TrdnE9Q9K5 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TrdnE9Q9K5 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TrdnE9Q9K5 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TrdnE9Q9K5 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TrdnE9Q9K5 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TrdnE9Q9K5 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TrdnE9Q9K5 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TrdnE9Q9K5 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TrdnE9Q9K5 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TrdnE9Q9K5 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TrdnE9Q9K5 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TrdnE9Q9K5 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TrdnE9Q9K5 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TrdnE9Q9K5 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TrdnE9Q9K5 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TrdnE9Q9K5 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TrdnE9Q9K5 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TrdnE9Q9K5 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TrdnE9Q9K5 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TrdnE9Q9K5 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TrdnE9Q9K5 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TrdnE9Q9K5 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TrdnE9Q9K5 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TrdnE9Q9K5 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TrdnE9Q9K5 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TrdnE9Q9K5 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TrdnE9Q9K5 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TrdnE9Q9K5 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TrdnE9Q9K5 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TrdnE9Q9K5 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TrdnE9Q9K5 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TrdnE9Q9K5 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TrdnE9Q9K5 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TrdnE9Q9K5 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TrdnE9Q9K5 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TrdnE9Q9K5 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TrdnE9Q9K5 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TrdnE9Q9K5 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TrdnE9Q9K5 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TrdnE9Q9K5 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
TrdnE9Q9K5 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TrdnE9Q9K5 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TrdnE9Q9K5 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TrdnE9Q9K5 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TrdnE9Q9K5 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TrdnE9Q9K5 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TrdnE9Q9K5 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TrdnE9Q9K5 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TrdnE9Q9K5 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TrdnE9Q9K5 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TrdnE9Q9K5 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TrdnE9Q9K5 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TrdnE9Q9K5 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TrdnE9Q9K5 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TrdnE9Q9K5 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TrdnE9Q9K5 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TrdnE9Q9K5 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TrdnE9Q9K5 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TrdnE9Q9K5 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TrdnE9Q9K5 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TrdnE9Q9K5 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TrdnE9Q9K5 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TrdnE9Q9K5 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TrdnE9Q9K5 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TrdnE9Q9K5 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TrdnE9Q9K5 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TrdnE9Q9K5 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TrdnE9Q9K5 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TrdnE9Q9K5 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms