Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9D8

Ankrd35, Ankyrin repeat domain 35, mousemouse

Predictions only

Length 996 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd35E9Q9D8 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ankrd35E9Q9D8 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ankrd35E9Q9D8 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ankrd35E9Q9D8 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ankrd35E9Q9D8 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ankrd35E9Q9D8 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ankrd35E9Q9D8 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ankrd35E9Q9D8 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ankrd35E9Q9D8 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ankrd35E9Q9D8 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ankrd35E9Q9D8 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ankrd35E9Q9D8 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ankrd35E9Q9D8 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ankrd35E9Q9D8 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ankrd35E9Q9D8 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ankrd35E9Q9D8 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ankrd35E9Q9D8 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ankrd35E9Q9D8 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ankrd35E9Q9D8 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ankrd35E9Q9D8 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ankrd35E9Q9D8 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ankrd35E9Q9D8 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ankrd35E9Q9D8 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ankrd35E9Q9D8 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ankrd35E9Q9D8 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ankrd35E9Q9D8 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ankrd35E9Q9D8 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ankrd35E9Q9D8 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ankrd35E9Q9D8 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ankrd35E9Q9D8 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ankrd35E9Q9D8 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ankrd35E9Q9D8 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ankrd35E9Q9D8 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ankrd35E9Q9D8 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ankrd35E9Q9D8 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ankrd35E9Q9D8 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ankrd35E9Q9D8 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ankrd35E9Q9D8 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ankrd35E9Q9D8 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ankrd35E9Q9D8 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ankrd35E9Q9D8 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ankrd35E9Q9D8 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ankrd35E9Q9D8 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ankrd35E9Q9D8 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ankrd35E9Q9D8 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ankrd35E9Q9D8 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ankrd35E9Q9D8 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ankrd35E9Q9D8 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ankrd35E9Q9D8 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ankrd35E9Q9D8 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ankrd35E9Q9D8 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ankrd35E9Q9D8 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ankrd35E9Q9D8 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ankrd35E9Q9D8 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ankrd35E9Q9D8 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ankrd35E9Q9D8 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ankrd35E9Q9D8 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ankrd35E9Q9D8 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ankrd35E9Q9D8 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ankrd35E9Q9D8 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ankrd35E9Q9D8 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ankrd35E9Q9D8 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ankrd35E9Q9D8 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ankrd35E9Q9D8 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ankrd35E9Q9D8 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ankrd35E9Q9D8 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ankrd35E9Q9D8 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ankrd35E9Q9D8 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ankrd35E9Q9D8 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ankrd35E9Q9D8 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ankrd35E9Q9D8 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ankrd35E9Q9D8 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ankrd35E9Q9D8 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ankrd35E9Q9D8 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ankrd35E9Q9D8 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ankrd35E9Q9D8 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ankrd35E9Q9D8 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ankrd35E9Q9D8 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ankrd35E9Q9D8 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ankrd35E9Q9D8 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ankrd35E9Q9D8 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ankrd35E9Q9D8 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ankrd35E9Q9D8 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ankrd35E9Q9D8 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ankrd35E9Q9D8 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ankrd35E9Q9D8 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ankrd35E9Q9D8 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ankrd35E9Q9D8 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ankrd35E9Q9D8 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ankrd35E9Q9D8 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ankrd35E9Q9D8 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ankrd35E9Q9D8 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ankrd35E9Q9D8 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ankrd35E9Q9D8 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ankrd35E9Q9D8 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ankrd35E9Q9D8 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ankrd35E9Q9D8 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ankrd35E9Q9D8 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ankrd35E9Q9D8 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ankrd35E9Q9D8 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms