Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7U0

Kcnmb3, Potassium large conductance calcium-activated channel, subfamily M, beta member 3, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnmb3E9Q7U0 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnmb3E9Q7U0 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnmb3E9Q7U0 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnmb3E9Q7U0 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnmb3E9Q7U0 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnmb3E9Q7U0 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnmb3E9Q7U0 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnmb3E9Q7U0 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Kcnmb3E9Q7U0 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
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Kcnmb3E9Q7U0 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Kcnmb3E9Q7U0 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcnmb3E9Q7U0 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcnmb3E9Q7U0 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcnmb3E9Q7U0 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcnmb3E9Q7U0 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Kcnmb3E9Q7U0 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcnmb3E9Q7U0 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcnmb3E9Q7U0 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Kcnmb3E9Q7U0 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Kcnmb3E9Q7U0 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcnmb3E9Q7U0 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcnmb3E9Q7U0 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcnmb3E9Q7U0 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcnmb3E9Q7U0 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcnmb3E9Q7U0 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcnmb3E9Q7U0 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcnmb3E9Q7U0 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcnmb3E9Q7U0 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcnmb3E9Q7U0 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcnmb3E9Q7U0 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnmb3E9Q7U0 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnmb3E9Q7U0 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnmb3E9Q7U0 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnmb3E9Q7U0 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnmb3E9Q7U0 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnmb3E9Q7U0 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnmb3E9Q7U0 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnmb3E9Q7U0 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnmb3E9Q7U0 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnmb3E9Q7U0 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnmb3E9Q7U0 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnmb3E9Q7U0 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnmb3E9Q7U0 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnmb3E9Q7U0 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnmb3E9Q7U0 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnmb3E9Q7U0 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnmb3E9Q7U0 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnmb3E9Q7U0 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnmb3E9Q7U0 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnmb3E9Q7U0 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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