Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Urb2E9Q7L1 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Urb2E9Q7L1 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Urb2E9Q7L1 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Urb2E9Q7L1 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Urb2E9Q7L1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Urb2E9Q7L1 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Urb2E9Q7L1 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Urb2E9Q7L1 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Urb2E9Q7L1 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Urb2E9Q7L1 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Urb2E9Q7L1 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Urb2E9Q7L1 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Urb2E9Q7L1 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Urb2E9Q7L1 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Urb2E9Q7L1 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Urb2E9Q7L1 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Urb2E9Q7L1 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Urb2E9Q7L1 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Urb2E9Q7L1 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Urb2E9Q7L1 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Urb2E9Q7L1 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Urb2E9Q7L1 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Urb2E9Q7L1 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Urb2E9Q7L1 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Urb2E9Q7L1 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Urb2E9Q7L1 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Urb2E9Q7L1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Urb2E9Q7L1 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Urb2E9Q7L1 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Urb2E9Q7L1 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Urb2E9Q7L1 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Urb2E9Q7L1 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Urb2E9Q7L1 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Urb2E9Q7L1 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Urb2E9Q7L1 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Urb2E9Q7L1 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Urb2E9Q7L1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Urb2E9Q7L1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Urb2E9Q7L1 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Urb2E9Q7L1 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Urb2E9Q7L1 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Urb2E9Q7L1 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Urb2E9Q7L1 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Urb2E9Q7L1 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Urb2E9Q7L1 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Urb2E9Q7L1 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Urb2E9Q7L1 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Urb2E9Q7L1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Urb2E9Q7L1 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Urb2E9Q7L1 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Urb2E9Q7L1 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Urb2E9Q7L1 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Urb2E9Q7L1 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Urb2E9Q7L1 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Urb2E9Q7L1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Urb2E9Q7L1 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Urb2E9Q7L1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Urb2E9Q7L1 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Urb2E9Q7L1 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Urb2E9Q7L1 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Urb2E9Q7L1 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Urb2E9Q7L1 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Urb2E9Q7L1 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Urb2E9Q7L1 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Urb2E9Q7L1 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Urb2E9Q7L1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Urb2E9Q7L1 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Urb2E9Q7L1 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Urb2E9Q7L1 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Urb2E9Q7L1 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Urb2E9Q7L1 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Urb2E9Q7L1 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Urb2E9Q7L1 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Urb2E9Q7L1 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Urb2E9Q7L1 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Urb2E9Q7L1 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Urb2E9Q7L1 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Urb2E9Q7L1 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Urb2E9Q7L1 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Urb2E9Q7L1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Urb2E9Q7L1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Urb2E9Q7L1 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Urb2E9Q7L1 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Urb2E9Q7L1 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Urb2E9Q7L1 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Urb2E9Q7L1 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Urb2E9Q7L1 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Urb2E9Q7L1 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Urb2E9Q7L1 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Urb2E9Q7L1 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Urb2E9Q7L1 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Urb2E9Q7L1 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Urb2E9Q7L1 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Urb2E9Q7L1 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Urb2E9Q7L1 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Urb2E9Q7L1 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Urb2E9Q7L1 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Urb2E9Q7L1 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Urb2E9Q7L1 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms