Protein–RNA interactions for Protein: E9Q373

Vmn1r238, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r238E9Q373 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r238E9Q373 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r238E9Q373 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r238E9Q373 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r238E9Q373 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r238E9Q373 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r238E9Q373 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r238E9Q373 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r238E9Q373 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r238E9Q373 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r238E9Q373 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r238E9Q373 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r238E9Q373 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r238E9Q373 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r238E9Q373 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r238E9Q373 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r238E9Q373 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r238E9Q373 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r238E9Q373 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r238E9Q373 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r238E9Q373 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r238E9Q373 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r238E9Q373 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r238E9Q373 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r238E9Q373 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r238E9Q373 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r238E9Q373 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vmn1r238E9Q373 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vmn1r238E9Q373 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vmn1r238E9Q373 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vmn1r238E9Q373 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vmn1r238E9Q373 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vmn1r238E9Q373 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vmn1r238E9Q373 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vmn1r238E9Q373 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vmn1r238E9Q373 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vmn1r238E9Q373 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vmn1r238E9Q373 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vmn1r238E9Q373 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vmn1r238E9Q373 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Vmn1r238E9Q373 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Vmn1r238E9Q373 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vmn1r238E9Q373 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vmn1r238E9Q373 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Vmn1r238E9Q373 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vmn1r238E9Q373 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vmn1r238E9Q373 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vmn1r238E9Q373 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vmn1r238E9Q373 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vmn1r238E9Q373 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vmn1r238E9Q373 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vmn1r238E9Q373 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vmn1r238E9Q373 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vmn1r238E9Q373 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vmn1r238E9Q373 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vmn1r238E9Q373 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vmn1r238E9Q373 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Vmn1r238E9Q373 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vmn1r238E9Q373 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vmn1r238E9Q373 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vmn1r238E9Q373 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vmn1r238E9Q373 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vmn1r238E9Q373 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vmn1r238E9Q373 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vmn1r238E9Q373 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vmn1r238E9Q373 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vmn1r238E9Q373 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vmn1r238E9Q373 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vmn1r238E9Q373 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vmn1r238E9Q373 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vmn1r238E9Q373 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vmn1r238E9Q373 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vmn1r238E9Q373 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vmn1r238E9Q373 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vmn1r238E9Q373 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vmn1r238E9Q373 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vmn1r238E9Q373 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vmn1r238E9Q373 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Vmn1r238E9Q373 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vmn1r238E9Q373 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vmn1r238E9Q373 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vmn1r238E9Q373 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vmn1r238E9Q373 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vmn1r238E9Q373 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vmn1r238E9Q373 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vmn1r238E9Q373 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vmn1r238E9Q373 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vmn1r238E9Q373 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vmn1r238E9Q373 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vmn1r238E9Q373 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vmn1r238E9Q373 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vmn1r238E9Q373 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vmn1r238E9Q373 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vmn1r238E9Q373 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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