Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
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Pdzd2E9Q1M1 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
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Pdzd2E9Q1M1 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
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Pdzd2E9Q1M1 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
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Pdzd2E9Q1M1 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
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Pdzd2E9Q1M1 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
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Pdzd2E9Q1M1 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
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