Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Brd1E9PZ26 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms