Protein–RNA interactions for Protein: E9PW72

Gm3002, Predicted gene 3002, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3002E9PW72 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3002E9PW72 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3002E9PW72 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3002E9PW72 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3002E9PW72 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3002E9PW72 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3002E9PW72 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3002E9PW72 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3002E9PW72 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3002E9PW72 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3002E9PW72 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3002E9PW72 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3002E9PW72 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3002E9PW72 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3002E9PW72 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3002E9PW72 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3002E9PW72 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3002E9PW72 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3002E9PW72 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3002E9PW72 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3002E9PW72 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3002E9PW72 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3002E9PW72 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3002E9PW72 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3002E9PW72 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3002E9PW72 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3002E9PW72 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3002E9PW72 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3002E9PW72 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3002E9PW72 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3002E9PW72 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3002E9PW72 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3002E9PW72 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3002E9PW72 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3002E9PW72 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm3002E9PW72 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm3002E9PW72 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm3002E9PW72 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm3002E9PW72 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3002E9PW72 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms