Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3L3

Trim12c, Tripartite motif-containing 12C, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12cD3Z3L3 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim12cD3Z3L3 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms