Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms