Protein–RNA interactions for Protein: D3YZZ2

Tgfbr3l, Transforming growth factor, beta receptor III-like, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfbr3lD3YZZ2 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms