Protein–RNA interactions for Protein: D3YV10

Ccdc13, Coiled-coil domain-containing protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc13D3YV10 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms