Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cttnbp2B9EJA2 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cttnbp2B9EJA2 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cttnbp2B9EJA2 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cttnbp2B9EJA2 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cttnbp2B9EJA2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cttnbp2B9EJA2 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cttnbp2B9EJA2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cttnbp2B9EJA2 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cttnbp2B9EJA2 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cttnbp2B9EJA2 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cttnbp2B9EJA2 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cttnbp2B9EJA2 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cttnbp2B9EJA2 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cttnbp2B9EJA2 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cttnbp2B9EJA2 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Cttnbp2B9EJA2 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cttnbp2B9EJA2 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cttnbp2B9EJA2 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cttnbp2B9EJA2 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cttnbp2B9EJA2 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cttnbp2B9EJA2 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cttnbp2B9EJA2 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Cttnbp2B9EJA2 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cttnbp2B9EJA2 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cttnbp2B9EJA2 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cttnbp2B9EJA2 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cttnbp2B9EJA2 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cttnbp2B9EJA2 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cttnbp2B9EJA2 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cttnbp2B9EJA2 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cttnbp2B9EJA2 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cttnbp2B9EJA2 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cttnbp2B9EJA2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cttnbp2B9EJA2 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cttnbp2B9EJA2 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cttnbp2B9EJA2 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cttnbp2B9EJA2 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cttnbp2B9EJA2 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cttnbp2B9EJA2 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cttnbp2B9EJA2 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cttnbp2B9EJA2 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cttnbp2B9EJA2 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Cttnbp2B9EJA2 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Cttnbp2B9EJA2 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cttnbp2B9EJA2 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cttnbp2B9EJA2 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cttnbp2B9EJA2 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cttnbp2B9EJA2 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Cttnbp2B9EJA2 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cttnbp2B9EJA2 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cttnbp2B9EJA2 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Cttnbp2B9EJA2 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cttnbp2B9EJA2 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cttnbp2B9EJA2 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cttnbp2B9EJA2 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cttnbp2B9EJA2 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cttnbp2B9EJA2 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cttnbp2B9EJA2 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cttnbp2B9EJA2 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cttnbp2B9EJA2 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cttnbp2B9EJA2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cttnbp2B9EJA2 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cttnbp2B9EJA2 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Cttnbp2B9EJA2 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cttnbp2B9EJA2 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Cttnbp2B9EJA2 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cttnbp2B9EJA2 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cttnbp2B9EJA2 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cttnbp2B9EJA2 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cttnbp2B9EJA2 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cttnbp2B9EJA2 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cttnbp2B9EJA2 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Cttnbp2B9EJA2 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cttnbp2B9EJA2 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cttnbp2B9EJA2 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cttnbp2B9EJA2 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cttnbp2B9EJA2 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cttnbp2B9EJA2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cttnbp2B9EJA2 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cttnbp2B9EJA2 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cttnbp2B9EJA2 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cttnbp2B9EJA2 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cttnbp2B9EJA2 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Cttnbp2B9EJA2 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cttnbp2B9EJA2 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cttnbp2B9EJA2 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cttnbp2B9EJA2 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Cttnbp2B9EJA2 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cttnbp2B9EJA2 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cttnbp2B9EJA2 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cttnbp2B9EJA2 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cttnbp2B9EJA2 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cttnbp2B9EJA2 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cttnbp2B9EJA2 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cttnbp2B9EJA2 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Cttnbp2B9EJA2 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cttnbp2B9EJA2 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cttnbp2B9EJA2 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cttnbp2B9EJA2 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms