Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ80

Pdzd8, PDZ domain-containing protein 8, mousemouse

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Length 1,147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd8B9EJ80 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Pdzd8B9EJ80 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Pdzd8B9EJ80 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
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Pdzd8B9EJ80 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Pdzd8B9EJ80 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Pdzd8B9EJ80 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Pdzd8B9EJ80 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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