Protein–RNA interactions for Protein: B8JJN0

Gm20547, Predicted gene 20547, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20547B8JJN0 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20547B8JJN0 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20547B8JJN0 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20547B8JJN0 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20547B8JJN0 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20547B8JJN0 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20547B8JJN0 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20547B8JJN0 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20547B8JJN0 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20547B8JJN0 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20547B8JJN0 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm20547B8JJN0 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm20547B8JJN0 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm20547B8JJN0 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm20547B8JJN0 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm20547B8JJN0 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm20547B8JJN0 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20547B8JJN0 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm20547B8JJN0 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20547B8JJN0 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20547B8JJN0 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm20547B8JJN0 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm20547B8JJN0 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm20547B8JJN0 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm20547B8JJN0 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm20547B8JJN0 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm20547B8JJN0 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm20547B8JJN0 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm20547B8JJN0 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm20547B8JJN0 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm20547B8JJN0 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20547B8JJN0 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm20547B8JJN0 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm20547B8JJN0 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20547B8JJN0 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20547B8JJN0 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20547B8JJN0 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm20547B8JJN0 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20547B8JJN0 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20547B8JJN0 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20547B8JJN0 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20547B8JJN0 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20547B8JJN0 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20547B8JJN0 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20547B8JJN0 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20547B8JJN0 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm20547B8JJN0 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20547B8JJN0 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20547B8JJN0 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20547B8JJN0 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20547B8JJN0 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20547B8JJN0 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20547B8JJN0 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20547B8JJN0 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20547B8JJN0 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20547B8JJN0 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20547B8JJN0 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20547B8JJN0 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20547B8JJN0 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20547B8JJN0 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20547B8JJN0 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20547B8JJN0 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20547B8JJN0 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20547B8JJN0 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20547B8JJN0 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20547B8JJN0 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20547B8JJN0 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gm20547B8JJN0 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20547B8JJN0 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20547B8JJN0 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20547B8JJN0 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20547B8JJN0 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20547B8JJN0 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20547B8JJN0 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20547B8JJN0 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20547B8JJN0 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20547B8JJN0 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20547B8JJN0 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20547B8JJN0 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20547B8JJN0 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20547B8JJN0 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20547B8JJN0 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gm20547B8JJN0 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20547B8JJN0 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gm20547B8JJN0 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20547B8JJN0 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gm20547B8JJN0 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20547B8JJN0 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm20547B8JJN0 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm20547B8JJN0 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm20547B8JJN0 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm20547B8JJN0 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm20547B8JJN0 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm20547B8JJN0 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm20547B8JJN0 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20547B8JJN0 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20547B8JJN0 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20547B8JJN0 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20547B8JJN0 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20547B8JJN0 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms