Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rrn3B2RS91 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms