Protein–RNA interactions for Protein: B1B0R1

Gm2012, Predicted gene 2012, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2012B1B0R1 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm2012B1B0R1 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm2012B1B0R1 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm2012B1B0R1 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm2012B1B0R1 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm2012B1B0R1 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm2012B1B0R1 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm2012B1B0R1 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm2012B1B0R1 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm2012B1B0R1 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm2012B1B0R1 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm2012B1B0R1 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm2012B1B0R1 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm2012B1B0R1 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm2012B1B0R1 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm2012B1B0R1 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm2012B1B0R1 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm2012B1B0R1 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm2012B1B0R1 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm2012B1B0R1 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm2012B1B0R1 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm2012B1B0R1 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm2012B1B0R1 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm2012B1B0R1 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm2012B1B0R1 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm2012B1B0R1 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm2012B1B0R1 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm2012B1B0R1 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm2012B1B0R1 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm2012B1B0R1 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm2012B1B0R1 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm2012B1B0R1 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm2012B1B0R1 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm2012B1B0R1 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm2012B1B0R1 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm2012B1B0R1 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm2012B1B0R1 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm2012B1B0R1 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm2012B1B0R1 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm2012B1B0R1 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm2012B1B0R1 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm2012B1B0R1 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm2012B1B0R1 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm2012B1B0R1 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm2012B1B0R1 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm2012B1B0R1 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm2012B1B0R1 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm2012B1B0R1 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm2012B1B0R1 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm2012B1B0R1 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm2012B1B0R1 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.4 ms