Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nipsnap3aB1AWZ3 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms