Protein–RNA interactions for Protein: B1AVK5

Col4a6, Collagen, type IV, alpha 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a6B1AVK5 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col4a6B1AVK5 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col4a6B1AVK5 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col4a6B1AVK5 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Col4a6B1AVK5 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Col4a6B1AVK5 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Col4a6B1AVK5 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Col4a6B1AVK5 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col4a6B1AVK5 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col4a6B1AVK5 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Col4a6B1AVK5 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col4a6B1AVK5 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col4a6B1AVK5 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col4a6B1AVK5 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col4a6B1AVK5 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col4a6B1AVK5 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col4a6B1AVK5 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col4a6B1AVK5 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col4a6B1AVK5 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col4a6B1AVK5 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col4a6B1AVK5 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col4a6B1AVK5 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col4a6B1AVK5 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col4a6B1AVK5 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Col4a6B1AVK5 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col4a6B1AVK5 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Col4a6B1AVK5 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col4a6B1AVK5 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col4a6B1AVK5 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col4a6B1AVK5 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col4a6B1AVK5 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a6B1AVK5 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a6B1AVK5 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a6B1AVK5 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a6B1AVK5 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a6B1AVK5 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a6B1AVK5 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a6B1AVK5 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a6B1AVK5 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a6B1AVK5 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a6B1AVK5 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a6B1AVK5 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a6B1AVK5 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a6B1AVK5 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a6B1AVK5 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a6B1AVK5 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a6B1AVK5 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a6B1AVK5 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col4a6B1AVK5 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col4a6B1AVK5 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col4a6B1AVK5 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Col4a6B1AVK5 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Col4a6B1AVK5 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Col4a6B1AVK5 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col4a6B1AVK5 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col4a6B1AVK5 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col4a6B1AVK5 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col4a6B1AVK5 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col4a6B1AVK5 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col4a6B1AVK5 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a6B1AVK5 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms