Protein–RNA interactions for Protein: B1AV28

Gm14862, Predicted gene 14862, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm14862B1AV28 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm14862B1AV28 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm14862B1AV28 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm14862B1AV28 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm14862B1AV28 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm14862B1AV28 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm14862B1AV28 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm14862B1AV28 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm14862B1AV28 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm14862B1AV28 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm14862B1AV28 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm14862B1AV28 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm14862B1AV28 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm14862B1AV28 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm14862B1AV28 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm14862B1AV28 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm14862B1AV28 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm14862B1AV28 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm14862B1AV28 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm14862B1AV28 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm14862B1AV28 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm14862B1AV28 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm14862B1AV28 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm14862B1AV28 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm14862B1AV28 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm14862B1AV28 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm14862B1AV28 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm14862B1AV28 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm14862B1AV28 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm14862B1AV28 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm14862B1AV28 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm14862B1AV28 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm14862B1AV28 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm14862B1AV28 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm14862B1AV28 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm14862B1AV28 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm14862B1AV28 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm14862B1AV28 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm14862B1AV28 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm14862B1AV28 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm14862B1AV28 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm14862B1AV28 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm14862B1AV28 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm14862B1AV28 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm14862B1AV28 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm14862B1AV28 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm14862B1AV28 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm14862B1AV28 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm14862B1AV28 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm14862B1AV28 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm14862B1AV28 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm14862B1AV28 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm14862B1AV28 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm14862B1AV28 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm14862B1AV28 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm14862B1AV28 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm14862B1AV28 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm14862B1AV28 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm14862B1AV28 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm14862B1AV28 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm14862B1AV28 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm14862B1AV28 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm14862B1AV28 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm14862B1AV28 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm14862B1AV28 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm14862B1AV28 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm14862B1AV28 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm14862B1AV28 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm14862B1AV28 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm14862B1AV28 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm14862B1AV28 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm14862B1AV28 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm14862B1AV28 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm14862B1AV28 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm14862B1AV28 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm14862B1AV28 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm14862B1AV28 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm14862B1AV28 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm14862B1AV28 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm14862B1AV28 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm14862B1AV28 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm14862B1AV28 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm14862B1AV28 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm14862B1AV28 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm14862B1AV28 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm14862B1AV28 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm14862B1AV28 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm14862B1AV28 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm14862B1AV28 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm14862B1AV28 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm14862B1AV28 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm14862B1AV28 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm14862B1AV28 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm14862B1AV28 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm14862B1AV28 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm14862B1AV28 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm14862B1AV28 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm14862B1AV28 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm14862B1AV28 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm14862B1AV28 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms