Protein–RNA interactions for Protein: B1ARV6

Pramef20, PRAME family member 20, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef20B1ARV6 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pramef20B1ARV6 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pramef20B1ARV6 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pramef20B1ARV6 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pramef20B1ARV6 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pramef20B1ARV6 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pramef20B1ARV6 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pramef20B1ARV6 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pramef20B1ARV6 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pramef20B1ARV6 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pramef20B1ARV6 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pramef20B1ARV6 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pramef20B1ARV6 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pramef20B1ARV6 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pramef20B1ARV6 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pramef20B1ARV6 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pramef20B1ARV6 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pramef20B1ARV6 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pramef20B1ARV6 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pramef20B1ARV6 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pramef20B1ARV6 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pramef20B1ARV6 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pramef20B1ARV6 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pramef20B1ARV6 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pramef20B1ARV6 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pramef20B1ARV6 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pramef20B1ARV6 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pramef20B1ARV6 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pramef20B1ARV6 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pramef20B1ARV6 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pramef20B1ARV6 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pramef20B1ARV6 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pramef20B1ARV6 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pramef20B1ARV6 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pramef20B1ARV6 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pramef20B1ARV6 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pramef20B1ARV6 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramef20B1ARV6 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramef20B1ARV6 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramef20B1ARV6 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramef20B1ARV6 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramef20B1ARV6 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramef20B1ARV6 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramef20B1ARV6 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramef20B1ARV6 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramef20B1ARV6 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramef20B1ARV6 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramef20B1ARV6 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramef20B1ARV6 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramef20B1ARV6 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramef20B1ARV6 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramef20B1ARV6 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramef20B1ARV6 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramef20B1ARV6 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramef20B1ARV6 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramef20B1ARV6 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramef20B1ARV6 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramef20B1ARV6 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramef20B1ARV6 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramef20B1ARV6 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramef20B1ARV6 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramef20B1ARV6 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramef20B1ARV6 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramef20B1ARV6 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramef20B1ARV6 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramef20B1ARV6 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramef20B1ARV6 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramef20B1ARV6 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramef20B1ARV6 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramef20B1ARV6 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramef20B1ARV6 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramef20B1ARV6 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramef20B1ARV6 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramef20B1ARV6 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramef20B1ARV6 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramef20B1ARV6 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramef20B1ARV6 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramef20B1ARV6 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramef20B1ARV6 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramef20B1ARV6 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramef20B1ARV6 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramef20B1ARV6 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramef20B1ARV6 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramef20B1ARV6 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramef20B1ARV6 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramef20B1ARV6 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramef20B1ARV6 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramef20B1ARV6 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramef20B1ARV6 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramef20B1ARV6 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramef20B1ARV6 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramef20B1ARV6 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramef20B1ARV6 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramef20B1ARV6 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramef20B1ARV6 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramef20B1ARV6 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramef20B1ARV6 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramef20B1ARV6 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramef20B1ARV6 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramef20B1ARV6 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms