Protein–RNA interactions for Protein: B1ARI9

Prr29, Proline-rich protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr29B1ARI9 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prr29B1ARI9 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prr29B1ARI9 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prr29B1ARI9 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prr29B1ARI9 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prr29B1ARI9 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prr29B1ARI9 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prr29B1ARI9 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prr29B1ARI9 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prr29B1ARI9 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prr29B1ARI9 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prr29B1ARI9 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prr29B1ARI9 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prr29B1ARI9 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prr29B1ARI9 Hsd11b1-203ENSMUST00000160929 1256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prr29B1ARI9 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Prr29B1ARI9 1700022E09Rik-202ENSMUST00000188342 387 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prr29B1ARI9 Gm42919-201ENSMUST00000197753 1284 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Prr29B1ARI9 4930513D17Rik-203ENSMUST00000202800 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prr29B1ARI9 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prr29B1ARI9 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prr29B1ARI9 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prr29B1ARI9 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prr29B1ARI9 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prr29B1ARI9 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prr29B1ARI9 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prr29B1ARI9 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prr29B1ARI9 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prr29B1ARI9 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prr29B1ARI9 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prr29B1ARI9 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prr29B1ARI9 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prr29B1ARI9 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prr29B1ARI9 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prr29B1ARI9 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prr29B1ARI9 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prr29B1ARI9 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prr29B1ARI9 Gm26952-201ENSMUST00000181996 409 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prr29B1ARI9 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prr29B1ARI9 Gm36278-201ENSMUST00000217030 918 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prr29B1ARI9 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prr29B1ARI9 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prr29B1ARI9 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prr29B1ARI9 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prr29B1ARI9 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prr29B1ARI9 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prr29B1ARI9 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prr29B1ARI9 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prr29B1ARI9 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prr29B1ARI9 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prr29B1ARI9 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prr29B1ARI9 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prr29B1ARI9 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prr29B1ARI9 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Prr29B1ARI9 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prr29B1ARI9 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Prr29B1ARI9 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Prr29B1ARI9 Gm17917-201ENSMUST00000218561 953 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Prr29B1ARI9 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Prr29B1ARI9 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prr29B1ARI9 AC154252.1-201ENSMUST00000226041 473 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Prr29B1ARI9 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prr29B1ARI9 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prr29B1ARI9 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prr29B1ARI9 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Prr29B1ARI9 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prr29B1ARI9 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prr29B1ARI9 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prr29B1ARI9 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prr29B1ARI9 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prr29B1ARI9 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prr29B1ARI9 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prr29B1ARI9 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prr29B1ARI9 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prr29B1ARI9 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prr29B1ARI9 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prr29B1ARI9 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Prr29B1ARI9 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Prr29B1ARI9 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Prr29B1ARI9 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Prr29B1ARI9 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Prr29B1ARI9 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Prr29B1ARI9 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Prr29B1ARI9 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Prr29B1ARI9 Gm21147-201ENSMUST00000186046 913 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Prr29B1ARI9 Gm37809-201ENSMUST00000195050 931 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Prr29B1ARI9 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Prr29B1ARI9 Sult1e1-201ENSMUST00000031201 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Prr29B1ARI9 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Prr29B1ARI9 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Prr29B1ARI9 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Prr29B1ARI9 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Prr29B1ARI9 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Prr29B1ARI9 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Prr29B1ARI9 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Prr29B1ARI9 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Prr29B1ARI9 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Prr29B1ARI9 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Prr29B1ARI9 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Prr29B1ARI9 Ifna16-201ENSMUST00000105148 1010 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.3 ms