Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprsB0V2N1 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
PtprsB0V2N1 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PtprsB0V2N1 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
PtprsB0V2N1 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PtprsB0V2N1 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PtprsB0V2N1 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PtprsB0V2N1 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PtprsB0V2N1 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PtprsB0V2N1 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PtprsB0V2N1 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PtprsB0V2N1 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PtprsB0V2N1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PtprsB0V2N1 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
PtprsB0V2N1 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PtprsB0V2N1 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PtprsB0V2N1 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
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PtprsB0V2N1 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
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PtprsB0V2N1 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PtprsB0V2N1 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PtprsB0V2N1 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PtprsB0V2N1 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PtprsB0V2N1 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
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PtprsB0V2N1 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PtprsB0V2N1 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
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PtprsB0V2N1 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PtprsB0V2N1 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PtprsB0V2N1 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PtprsB0V2N1 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
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PtprsB0V2N1 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
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PtprsB0V2N1 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PtprsB0V2N1 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
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PtprsB0V2N1 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
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PtprsB0V2N1 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PtprsB0V2N1 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.11
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PtprsB0V2N1 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtprsB0V2N1 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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PtprsB0V2N1 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtprsB0V2N1 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtprsB0V2N1 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtprsB0V2N1 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtprsB0V2N1 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtprsB0V2N1 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtprsB0V2N1 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtprsB0V2N1 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtprsB0V2N1 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtprsB0V2N1 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtprsB0V2N1 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtprsB0V2N1 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtprsB0V2N1 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtprsB0V2N1 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtprsB0V2N1 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtprsB0V2N1 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtprsB0V2N1 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtprsB0V2N1 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtprsB0V2N1 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtprsB0V2N1 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtprsB0V2N1 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtprsB0V2N1 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtprsB0V2N1 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
PtprsB0V2N1 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtprsB0V2N1 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
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