Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-M5A7VMS3 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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