Protein–RNA interactions for Protein: A2RTF1

Catsperb, Cation channel sperm-associated protein subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatsperbA2RTF1 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CatsperbA2RTF1 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms