Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ25

Skt, Sickle tail protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SktA2AQ25 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SktA2AQ25 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SktA2AQ25 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SktA2AQ25 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SktA2AQ25 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SktA2AQ25 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SktA2AQ25 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SktA2AQ25 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SktA2AQ25 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SktA2AQ25 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SktA2AQ25 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SktA2AQ25 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SktA2AQ25 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SktA2AQ25 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SktA2AQ25 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SktA2AQ25 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SktA2AQ25 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SktA2AQ25 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SktA2AQ25 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SktA2AQ25 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SktA2AQ25 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SktA2AQ25 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SktA2AQ25 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SktA2AQ25 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SktA2AQ25 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SktA2AQ25 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SktA2AQ25 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SktA2AQ25 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SktA2AQ25 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SktA2AQ25 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SktA2AQ25 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SktA2AQ25 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SktA2AQ25 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SktA2AQ25 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SktA2AQ25 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SktA2AQ25 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SktA2AQ25 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SktA2AQ25 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SktA2AQ25 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SktA2AQ25 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SktA2AQ25 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SktA2AQ25 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SktA2AQ25 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SktA2AQ25 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SktA2AQ25 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SktA2AQ25 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SktA2AQ25 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SktA2AQ25 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SktA2AQ25 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SktA2AQ25 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SktA2AQ25 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SktA2AQ25 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SktA2AQ25 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SktA2AQ25 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SktA2AQ25 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SktA2AQ25 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SktA2AQ25 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SktA2AQ25 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SktA2AQ25 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SktA2AQ25 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SktA2AQ25 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SktA2AQ25 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SktA2AQ25 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SktA2AQ25 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SktA2AQ25 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SktA2AQ25 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SktA2AQ25 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SktA2AQ25 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SktA2AQ25 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SktA2AQ25 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SktA2AQ25 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SktA2AQ25 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SktA2AQ25 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SktA2AQ25 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SktA2AQ25 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SktA2AQ25 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SktA2AQ25 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SktA2AQ25 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SktA2AQ25 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SktA2AQ25 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SktA2AQ25 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SktA2AQ25 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SktA2AQ25 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SktA2AQ25 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SktA2AQ25 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SktA2AQ25 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SktA2AQ25 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SktA2AQ25 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SktA2AQ25 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SktA2AQ25 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SktA2AQ25 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SktA2AQ25 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SktA2AQ25 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
SktA2AQ25 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
SktA2AQ25 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SktA2AQ25 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SktA2AQ25 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SktA2AQ25 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SktA2AQ25 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SktA2AQ25 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms