Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Frmpd4A2AFR3 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms