Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pramef6A2A8M8 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Pramef6A2A8M8 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Pramef6A2A8M8 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pramef6A2A8M8 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pramef6A2A8M8 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pramef6A2A8M8 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pramef6A2A8M8 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pramef6A2A8M8 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pramef6A2A8M8 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pramef6A2A8M8 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pramef6A2A8M8 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pramef6A2A8M8 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pramef6A2A8M8 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pramef6A2A8M8 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pramef6A2A8M8 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pramef6A2A8M8 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Pramef6A2A8M8 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pramef6A2A8M8 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pramef6A2A8M8 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pramef6A2A8M8 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pramef6A2A8M8 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pramef6A2A8M8 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pramef6A2A8M8 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pramef6A2A8M8 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pramef6A2A8M8 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pramef6A2A8M8 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pramef6A2A8M8 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pramef6A2A8M8 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pramef6A2A8M8 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pramef6A2A8M8 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pramef6A2A8M8 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pramef6A2A8M8 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pramef6A2A8M8 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pramef6A2A8M8 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Pramef6A2A8M8 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Pramef6A2A8M8 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Pramef6A2A8M8 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Pramef6A2A8M8 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Pramef6A2A8M8 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Pramef6A2A8M8 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Pramef6A2A8M8 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Pramef6A2A8M8 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Pramef6A2A8M8 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Pramef6A2A8M8 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Pramef6A2A8M8 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Pramef6A2A8M8 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Pramef6A2A8M8 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Pramef6A2A8M8 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Pramef6A2A8M8 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Pramef6A2A8M8 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms