Protein–RNA interactions for Protein: A2A6Q5

Cdc27, Cell division cycle protein 27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc27A2A6Q5 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cdc27A2A6Q5 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms