Protein–RNA interactions for Protein: A2A4P4

Gm27029, Predicted gene, 27029, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm27029A2A4P4 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm27029A2A4P4 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm27029A2A4P4 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm27029A2A4P4 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm27029A2A4P4 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm27029A2A4P4 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm27029A2A4P4 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm27029A2A4P4 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm27029A2A4P4 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm27029A2A4P4 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm27029A2A4P4 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm27029A2A4P4 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm27029A2A4P4 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm27029A2A4P4 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm27029A2A4P4 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm27029A2A4P4 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm27029A2A4P4 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm27029A2A4P4 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm27029A2A4P4 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm27029A2A4P4 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm27029A2A4P4 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm27029A2A4P4 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm27029A2A4P4 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm27029A2A4P4 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm27029A2A4P4 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm27029A2A4P4 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm27029A2A4P4 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm27029A2A4P4 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm27029A2A4P4 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm27029A2A4P4 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm27029A2A4P4 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm27029A2A4P4 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm27029A2A4P4 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm27029A2A4P4 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm27029A2A4P4 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm27029A2A4P4 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm27029A2A4P4 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm27029A2A4P4 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm27029A2A4P4 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm27029A2A4P4 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm27029A2A4P4 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm27029A2A4P4 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm27029A2A4P4 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm27029A2A4P4 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm27029A2A4P4 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm27029A2A4P4 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm27029A2A4P4 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm27029A2A4P4 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm27029A2A4P4 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm27029A2A4P4 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm27029A2A4P4 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm27029A2A4P4 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm27029A2A4P4 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm27029A2A4P4 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm27029A2A4P4 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm27029A2A4P4 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm27029A2A4P4 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm27029A2A4P4 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm27029A2A4P4 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm27029A2A4P4 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm27029A2A4P4 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm27029A2A4P4 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm27029A2A4P4 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm27029A2A4P4 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm27029A2A4P4 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm27029A2A4P4 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm27029A2A4P4 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm27029A2A4P4 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm27029A2A4P4 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm27029A2A4P4 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm27029A2A4P4 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm27029A2A4P4 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm27029A2A4P4 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm27029A2A4P4 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm27029A2A4P4 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm27029A2A4P4 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm27029A2A4P4 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm27029A2A4P4 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm27029A2A4P4 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm27029A2A4P4 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm27029A2A4P4 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm27029A2A4P4 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm27029A2A4P4 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm27029A2A4P4 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm27029A2A4P4 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm27029A2A4P4 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm27029A2A4P4 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm27029A2A4P4 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm27029A2A4P4 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm27029A2A4P4 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm27029A2A4P4 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm27029A2A4P4 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm27029A2A4P4 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm27029A2A4P4 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm27029A2A4P4 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm27029A2A4P4 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm27029A2A4P4 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm27029A2A4P4 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm27029A2A4P4 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm27029A2A4P4 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms