Protein–RNA interactions for Protein: A0A286YDB2

4930469K13Rik, RIKEN cDNA 4930469K13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
4930469K13RikA0A286YDB2 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms