Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIT1

Ccdc194, Coiled-coil domain-containing protein 194, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc194A0A140LIT1 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc194A0A140LIT1 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc194A0A140LIT1 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc194A0A140LIT1 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc194A0A140LIT1 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc194A0A140LIT1 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc194A0A140LIT1 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc194A0A140LIT1 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc194A0A140LIT1 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc194A0A140LIT1 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc194A0A140LIT1 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc194A0A140LIT1 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc194A0A140LIT1 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc194A0A140LIT1 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc194A0A140LIT1 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc194A0A140LIT1 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc194A0A140LIT1 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc194A0A140LIT1 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc194A0A140LIT1 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc194A0A140LIT1 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc194A0A140LIT1 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc194A0A140LIT1 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc194A0A140LIT1 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc194A0A140LIT1 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc194A0A140LIT1 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc194A0A140LIT1 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc194A0A140LIT1 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc194A0A140LIT1 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc194A0A140LIT1 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc194A0A140LIT1 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc194A0A140LIT1 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc194A0A140LIT1 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc194A0A140LIT1 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc194A0A140LIT1 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc194A0A140LIT1 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc194A0A140LIT1 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc194A0A140LIT1 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc194A0A140LIT1 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc194A0A140LIT1 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc194A0A140LIT1 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc194A0A140LIT1 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc194A0A140LIT1 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc194A0A140LIT1 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc194A0A140LIT1 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc194A0A140LIT1 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc194A0A140LIT1 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc194A0A140LIT1 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc194A0A140LIT1 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc194A0A140LIT1 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc194A0A140LIT1 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc194A0A140LIT1 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc194A0A140LIT1 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc194A0A140LIT1 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc194A0A140LIT1 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc194A0A140LIT1 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc194A0A140LIT1 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc194A0A140LIT1 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc194A0A140LIT1 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc194A0A140LIT1 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc194A0A140LIT1 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc194A0A140LIT1 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc194A0A140LIT1 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc194A0A140LIT1 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc194A0A140LIT1 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc194A0A140LIT1 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc194A0A140LIT1 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc194A0A140LIT1 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc194A0A140LIT1 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc194A0A140LIT1 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc194A0A140LIT1 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc194A0A140LIT1 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc194A0A140LIT1 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc194A0A140LIT1 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc194A0A140LIT1 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc194A0A140LIT1 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc194A0A140LIT1 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc194A0A140LIT1 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc194A0A140LIT1 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc194A0A140LIT1 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc194A0A140LIT1 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc194A0A140LIT1 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc194A0A140LIT1 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc194A0A140LIT1 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc194A0A140LIT1 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc194A0A140LIT1 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc194A0A140LIT1 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc194A0A140LIT1 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc194A0A140LIT1 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc194A0A140LIT1 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc194A0A140LIT1 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc194A0A140LIT1 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc194A0A140LIT1 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc194A0A140LIT1 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc194A0A140LIT1 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc194A0A140LIT1 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc194A0A140LIT1 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc194A0A140LIT1 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc194A0A140LIT1 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc194A0A140LIT1 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc194A0A140LIT1 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms