Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YYE3

Trbv15, T cell receptor beta, variable 15 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv15A0A0A6YYE3 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trbv15A0A0A6YYE3 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trbv15A0A0A6YYE3 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trbv15A0A0A6YYE3 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trbv15A0A0A6YYE3 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trbv15A0A0A6YYE3 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trbv15A0A0A6YYE3 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trbv15A0A0A6YYE3 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trbv15A0A0A6YYE3 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trbv15A0A0A6YYE3 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trbv15A0A0A6YYE3 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trbv15A0A0A6YYE3 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trbv15A0A0A6YYE3 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trbv15A0A0A6YYE3 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trbv15A0A0A6YYE3 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trbv15A0A0A6YYE3 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trbv15A0A0A6YYE3 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trbv15A0A0A6YYE3 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trbv15A0A0A6YYE3 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trbv15A0A0A6YYE3 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trbv15A0A0A6YYE3 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trbv15A0A0A6YYE3 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trbv15A0A0A6YYE3 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trbv15A0A0A6YYE3 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trbv15A0A0A6YYE3 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trbv15A0A0A6YYE3 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trbv15A0A0A6YYE3 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trbv15A0A0A6YYE3 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trbv15A0A0A6YYE3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trbv15A0A0A6YYE3 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trbv15A0A0A6YYE3 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trbv15A0A0A6YYE3 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trbv15A0A0A6YYE3 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trbv15A0A0A6YYE3 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trbv15A0A0A6YYE3 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trbv15A0A0A6YYE3 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trbv15A0A0A6YYE3 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trbv15A0A0A6YYE3 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trbv15A0A0A6YYE3 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trbv15A0A0A6YYE3 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trbv15A0A0A6YYE3 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trbv15A0A0A6YYE3 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trbv15A0A0A6YYE3 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trbv15A0A0A6YYE3 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trbv15A0A0A6YYE3 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trbv15A0A0A6YYE3 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trbv15A0A0A6YYE3 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trbv15A0A0A6YYE3 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trbv15A0A0A6YYE3 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trbv15A0A0A6YYE3 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trbv15A0A0A6YYE3 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trbv15A0A0A6YYE3 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trbv15A0A0A6YYE3 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Trbv15A0A0A6YYE3 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Trbv15A0A0A6YYE3 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trbv15A0A0A6YYE3 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Trbv15A0A0A6YYE3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trbv15A0A0A6YYE3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Trbv15A0A0A6YYE3 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trbv15A0A0A6YYE3 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trbv15A0A0A6YYE3 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trbv15A0A0A6YYE3 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trbv15A0A0A6YYE3 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trbv15A0A0A6YYE3 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trbv15A0A0A6YYE3 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Trbv15A0A0A6YYE3 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Trbv15A0A0A6YYE3 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trbv15A0A0A6YYE3 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Trbv15A0A0A6YYE3 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trbv15A0A0A6YYE3 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Trbv15A0A0A6YYE3 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trbv15A0A0A6YYE3 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trbv15A0A0A6YYE3 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trbv15A0A0A6YYE3 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trbv15A0A0A6YYE3 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trbv15A0A0A6YYE3 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trbv15A0A0A6YYE3 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trbv15A0A0A6YYE3 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trbv15A0A0A6YYE3 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trbv15A0A0A6YYE3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trbv15A0A0A6YYE3 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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