Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2W8

Gria4, Glutamate receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria4Q9Z2W8 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gria4Q9Z2W8 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gria4Q9Z2W8 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gria4Q9Z2W8 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gria4Q9Z2W8 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gria4Q9Z2W8 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gria4Q9Z2W8 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gria4Q9Z2W8 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gria4Q9Z2W8 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gria4Q9Z2W8 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gria4Q9Z2W8 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gria4Q9Z2W8 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gria4Q9Z2W8 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gria4Q9Z2W8 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gria4Q9Z2W8 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gria4Q9Z2W8 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gria4Q9Z2W8 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gria4Q9Z2W8 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gria4Q9Z2W8 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gria4Q9Z2W8 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gria4Q9Z2W8 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gria4Q9Z2W8 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gria4Q9Z2W8 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gria4Q9Z2W8 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gria4Q9Z2W8 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gria4Q9Z2W8 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gria4Q9Z2W8 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gria4Q9Z2W8 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gria4Q9Z2W8 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gria4Q9Z2W8 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gria4Q9Z2W8 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gria4Q9Z2W8 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gria4Q9Z2W8 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gria4Q9Z2W8 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gria4Q9Z2W8 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gria4Q9Z2W8 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gria4Q9Z2W8 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gria4Q9Z2W8 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gria4Q9Z2W8 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gria4Q9Z2W8 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gria4Q9Z2W8 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gria4Q9Z2W8 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gria4Q9Z2W8 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gria4Q9Z2W8 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gria4Q9Z2W8 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gria4Q9Z2W8 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gria4Q9Z2W8 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gria4Q9Z2W8 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gria4Q9Z2W8 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gria4Q9Z2W8 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gria4Q9Z2W8 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gria4Q9Z2W8 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gria4Q9Z2W8 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gria4Q9Z2W8 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gria4Q9Z2W8 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gria4Q9Z2W8 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gria4Q9Z2W8 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gria4Q9Z2W8 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gria4Q9Z2W8 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gria4Q9Z2W8 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gria4Q9Z2W8 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gria4Q9Z2W8 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gria4Q9Z2W8 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gria4Q9Z2W8 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gria4Q9Z2W8 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gria4Q9Z2W8 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gria4Q9Z2W8 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gria4Q9Z2W8 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gria4Q9Z2W8 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gria4Q9Z2W8 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gria4Q9Z2W8 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gria4Q9Z2W8 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gria4Q9Z2W8 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gria4Q9Z2W8 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gria4Q9Z2W8 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gria4Q9Z2W8 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gria4Q9Z2W8 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gria4Q9Z2W8 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gria4Q9Z2W8 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gria4Q9Z2W8 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gria4Q9Z2W8 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gria4Q9Z2W8 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gria4Q9Z2W8 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gria4Q9Z2W8 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gria4Q9Z2W8 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gria4Q9Z2W8 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gria4Q9Z2W8 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gria4Q9Z2W8 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gria4Q9Z2W8 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gria4Q9Z2W8 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gria4Q9Z2W8 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gria4Q9Z2W8 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gria4Q9Z2W8 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gria4Q9Z2W8 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gria4Q9Z2W8 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gria4Q9Z2W8 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gria4Q9Z2W8 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gria4Q9Z2W8 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gria4Q9Z2W8 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gria4Q9Z2W8 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms