Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q5

Mrpl40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl40Q9Z2Q5 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl40Q9Z2Q5 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl40Q9Z2Q5 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl40Q9Z2Q5 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl40Q9Z2Q5 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mrpl40Q9Z2Q5 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mrpl40Q9Z2Q5 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mrpl40Q9Z2Q5 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mrpl40Q9Z2Q5 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms